Implementasi DNA Similarity Matching pada Perangkat Mobile dengan Sugeno Fuzzy Inference System

Abstract

STR analysis merupakan teknik DNA profiling yang populer digunakan untuk mendapatkan profil DNA manusia yang bersifat unik dari sampel biologis yang didapatkan. Profil DNA tersebut terdiri dari beberapa lokus STR yang ditetapkan sebagai standar. Dalam praktiknya, permasalahan timbul ketika dalam proses analisis terjadi kontaminasi terhadap sampel biologis. Akibatnya, profil hasil proses analisis memiliki nilai ketidakpastian (uncertainty) atau nilai pergeseran dan noise. Untuk permasalahan seperti ini, perangkat lunak bantu untuk proses pencocokan kemiripan DNA yang dikembangkan oleh National Institute of Standards and Technology (NIST), yaitu STR_MatchSamples, tidak mampu menangani. Hal ini dikarenakan STR_MatchSamples bekerja dengan logika crisp, sedangkan data profil DNA memiliki nilai-nilai ketidakpastian. Maka, untuk mengatasi permasalahan ketidakpastian pada profil DNA, digunakan sebuah metode fuzzy untuk pencocokan kemiripan DNA, yaitu sistem inferensi fuzzy Sugeno. Pada paper ini diberikan penjelasan mengenai metode sistem inferensi fuzzy Sugeno sebagai metode untuk pencocokan kemiripan DNA beserta implementasinya sebagai aplikasi web service yang bekerja pada sebuah server. Aplikasi tersebut dapat diakses oleh perangkat mobile bersistem operasi Android sebagai client aplikasi web service tersebut.

CC Licencing

Authors who publish with this journal agree to the following terms:
- Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.
- Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.
- Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access).